- Viral/Pathogen Detection
- 병원성 박테리아(pathogenic bacteria)에 대한 치료 및 연구는 우수한 성과를 이루고 있는 반면, 병원성 바이러스(pathogenic virus)에 대한 치료 및 연구는 매우 빠른 변이 특성으로 인하여 즉각적인 진단과 치료의 적용이 어려운 분야입니다.
Virus는 보유한 핵산의 종류에 따라 크게 DNA virus와 RNA virus로 나뉘는데, 핵산의 종류와 형태에 따라 각 바이러스의 특성이 상이하며, 특히 RNA virus는 RNA의 돌연변이로 인하여 쉽게 변이되는 특성을 가지고 있습니다.
바이러스는 같은 뿌리에서 시작하더라도 변이로 인하여 나뭇가지처럼 다양한 분화가 빠르게 진행되므로, 바이러스 유전체 및 변이 연구는 신속하면서도 지속적으로 진행되어야 하며, 바이러스 유전체와 바이러스 단백질에 대한 분석 및 연구는 백신 개발 및 치료 메커니즘의 바탕이 되므로 바이러스 연구에서 중요한 요소라고 할 수 있습니다.
Exgene™ Viral DNA/RNA Kit는 다양한 viral sample에서 고품질의 DNA/RNA를 추출하여 다양한 downstream application에 적용할 수 있도록 개발된 제품입니다. 이번 application note는 널리 알려져 있는 주요 병원체 sample을 이용하여 자사 Exgene™ Viral DNA/RNA Kit와 타사 제품(2종)의 핵산 추출 성능 비교 및 sample의 serial dilution을 통한 Exgene™ Viral DNA/RNA Kit의 성능 검증을 진행한 내용입니다.
- Viral/Pathogen Detection
- 호흡기관 또는 기관지에 발생하는 질병인 호흡기 질환은 가장 흔하게 발병하는 질병으로 감염성질환, 기도 관련 질환, 악성 종양 등이 주요 질환으로 알려져 있습니다.
그 중, 감염성 호흡기 질환의 주요 원인은 virus이며, influenza나 corona virus 등과 같이 감염률과 감염 유행성이 높은 질병입니다. 일반적으로 감염성 호흡기 질환에 대한 검체 채취는 swab을 이용한 구인두도말 또는 비인두도말 방식을 사용합니다. 2015년 MERS(메르스) 및 2020년 COVID-19의 대유행으로 인해 감염성 호흡기 질환의 진단 및 치료를 위한 수요가 폭발적으로 증가하자, 이를 대량으로 처리가 가능한 자동화 핵산 추출 장비 및 제품에 대한 관심이 높아지게 되었습니다.
GENTi™ 32 Advanced Automatic Nucleic Acid Extraction System과 GENTi™ Advanced Viral DNA/RNA Extraction Kit는 다양한 검체로부터 viral 및 pathogen DNA/RNA를 추출 가능하며, 이 Application note는 조류의 호흡기 질병 병원체(Mycoplasma gallisepticum, Infectious bronchitis virus)에 감염된 rooster의 구강에서 cotton swab으로 검체를 채취한 뒤 GENTi™ Advanced Viral DNA/RNA Extraction Kit와 타사 제품을 이용하여 추출한 결과를 비교한 내용입니다.
- Viral/Pathogen Detection
- 병원체에 감염되는 감염 경로는 매우 다양하게 존재합니다. 그 중, 몇몇 병원체는 감염된 생명체가 배설한 분변을 통해 체외로 배출 되고 그것을 접촉한 대상을 교차 감염을 일으키기도 하므로 분자진단검사에 사용되는 다양한 임상 검체 중 하나입니다.
분변 검체로 감염 여부를 진단하는 방법은 분자진단검사 기법 중 하나인 Real-time PCR (qPCR) 또는 Real-time RT-PCR (qRT-PCR) 기법을 통해 판별이 가능합니다. 하지만, 분변 검체 속에 다량 존재하는 PCR inhibitor는 PCR 수행 시 방해 요소로 작용하기 때문에 분자진단 검체 중 까다로운 편에 속합니다. 분변 검체 속에 존재하는 PCR inhibitor를 제거하고 동시에 순수한 핵산만을 추출하는 기술은 정확한 분자진단검사를 하기 위한 중요한 기술 중 하나입니다.
GENTi™ 32 Advanced Automatic Extraction System과 GENTi™ Advanced Viral DNA/RNA Extraction Kit는 분변 검체 내 존재하는 PCR inhibitor를 효과적으로 제거할 수 있으며 다양한 병원체의 핵산 추출이 가능한 제품입니다. 이번 application note는 인위로 감염된 분변 검체를 GENTi™ 32 Advanced Automatic Extraction System과 GENTi™ Advanced Viral DNA/RNA Extraction Kit를 사용하여 Mycoplasma gallisepticum (MG)과 Infectious bronchitis virus (IBV)의 고순도 핵산을 추출한 후 Real-time PCR (qPCR)과 qRT-PCR를 통하여 확인한 결과입니다.
- Viral/Pathogen Detection
- 감염된 전혈(infected whole blood)은 병원체의 핵산을 추출하는데 자주 이용되는 검체이지만, 양질의 핵산 추출을 방해하는 혈색소(heme), 항응고제(EDTA 또는 heparin), 백혈구 및 기타 물질 등의 inhibitor를 다수 포함하고 있기 때문에 핵산 추출 시 inhibitor 제거 기술이 가장 중요합니다. 또한, 분자진단검사를 하기 위해서는 검체로부터 고순도의 핵산을 추출하고 효율적으로 처리하는 것도 중요합니다. 이러한 요소는 분자진단 시장이 성장하면서 더욱더 핵심 기술로 자리잡게 되었습니다. 그러므로 자동화 핵산 추출 시스템은 다량의 업무 흐름을 효율적으로 처리하고 양질의 핵산을 추출 하는데 중요한 위치를 차지하게 됐습니다.
Magnetic bead technology 기반의 GENTi™ 32 Advanced Automatic Extraction System과 GENTi™ Advanced Viral DNA/RNA Extraction Kit는 inhibitor가 다수 존재하는 혈액 검체로부터 high-quality의 병원체 DNA/RNA 추출이 가능한 제품입니다. 해당 자료는 인위 감염시킨 전혈을 GENTi™ 32 Advanced Automatic Extraction System와 GENTi™ Advanced Viral DNA/RNA Extraction Kit로 추출한 DNA/RNA를 template로 사용하여 qPCR과 qRT-PCR를 통하여 증폭을 확인한 결과입니다.
- Viral/Pathogen Detection
- 바이러스(virus)와 병원성 세균(pathogenic bacteria)는 동물, 식물, 박테리아 등 여러 생명체를 감염시키고 질병을 일으킵니다. 특히, 높은 변이율과 감염성을 가진 바이러스는 다양한 계통에서 여러 가지 질환을 일으키는 질병의 원인 중 하나입니다.
이번 application note에 소개드릴 GENTi™ Advanced Viral DNA/RNA Extraction Kit는 magnetic bead 기반의 자동화 핵산 추출 장비와 함께 사용 가능하며, 다양한 sample로부터 viral DNA/RNA를 신속하게 추출이 가능합니다. 특히, 세계적인 pandemic을 일으킨 COVID-19의 viral RNA를 추출하고자 여러 각국(말레이시아, 태국, 파키스탄, 체코, 파라과이 등)에서 사용하고 있는 제품입니다.
본 application note는 magnetic bead type의 자동화 핵산 추출 장비(GENTi™ 32 Advanced Automatic Extraction System)와 GENTi™ Advanced Viral DNA/RNA Extraction Kit를 이용하여 널리 알려져 있는 바이러스(IBV, RV, JEV)와 박테리아(MG)로부터 DNA/RNA를 추출하여 downstream application에 적용한 결과입니다.
- Viral Detection
- GENTi™ Advanced Viral DNA/RNA Extraction Kit는 바이러스 혹은 숙주 세포를 포함한 cell-free fluid, cell culture supernatant, plasma, serum, nasal swab, urine 등과 같은 다양한 임상 sample로부터 핵산을 정제하도록 설계된 체외 진단 의료기기입니다.
GENTi™ Advanced Viral DNA/RNA Extraction Kit는 magnetic bead를 이용한 자동화 핵산 정제 기술을 이용해 DNA 및 RNA를 가장 빠르고 편리하게 정제할 수 있습니다.
GENTi™ Advanced Viral DNA/RNA Extraction Kit의 buffer system은 고도로 최적화되었으며, 사용자 편의를 위해 다양한 임상 sample에서 핵산을 추출할 수 있는 범용성을 제공합니다. 대부분의 sample은 전처리 단계를 생략하거나 최소화하여 핵산 정제에 사용할 수 있습니다. 정제된 DNA 및 RNA는 추가 조작 없이 다양하게 활용 가능합니다.
GENTi™ Advanced Viral DNA/RNA Extraction Kit는 실온에서 사용 및 보관해야 합니다. 추출된 RNA는 일반 실험실 용품 및 먼지에서 흔히 발견되는 RNase와 같은 오염 물질에 취약하므로 특별한 주의를 요구하며 적절한 장비로 처리해야 합니다. RNA 안정성을 위해서는 RNA를 4°C에 보관하여 즉시 분석에 사용하거나, -70°C 이하에서 장기 보관하는 것이 좋습니다.
